Protein–RNA interactions for Protein: Q76B58

BRINP3, BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRINP3Q76B58 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
BRINP3Q76B58 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRINP3Q76B58 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRINP3Q76B58 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRINP3Q76B58 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRINP3Q76B58 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRINP3Q76B58 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRINP3Q76B58 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRINP3Q76B58 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRINP3Q76B58 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRINP3Q76B58 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRINP3Q76B58 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRINP3Q76B58 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRINP3Q76B58 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRINP3Q76B58 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRINP3Q76B58 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRINP3Q76B58 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRINP3Q76B58 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRINP3Q76B58 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRINP3Q76B58 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRINP3Q76B58 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRINP3Q76B58 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRINP3Q76B58 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRINP3Q76B58 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRINP3Q76B58 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRINP3Q76B58 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRINP3Q76B58 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRINP3Q76B58 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRINP3Q76B58 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRINP3Q76B58 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRINP3Q76B58 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRINP3Q76B58 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
BRINP3Q76B58 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
BRINP3Q76B58 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRINP3Q76B58 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRINP3Q76B58 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRINP3Q76B58 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRINP3Q76B58 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRINP3Q76B58 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRINP3Q76B58 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRINP3Q76B58 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRINP3Q76B58 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRINP3Q76B58 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRINP3Q76B58 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRINP3Q76B58 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRINP3Q76B58 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRINP3Q76B58 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRINP3Q76B58 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRINP3Q76B58 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRINP3Q76B58 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRINP3Q76B58 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRINP3Q76B58 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRINP3Q76B58 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRINP3Q76B58 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRINP3Q76B58 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
BRINP3Q76B58 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRINP3Q76B58 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRINP3Q76B58 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRINP3Q76B58 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
BRINP3Q76B58 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRINP3Q76B58 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRINP3Q76B58 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRINP3Q76B58 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRINP3Q76B58 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRINP3Q76B58 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRINP3Q76B58 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRINP3Q76B58 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRINP3Q76B58 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRINP3Q76B58 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRINP3Q76B58 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRINP3Q76B58 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
BRINP3Q76B58 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRINP3Q76B58 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRINP3Q76B58 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRINP3Q76B58 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRINP3Q76B58 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRINP3Q76B58 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRINP3Q76B58 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRINP3Q76B58 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRINP3Q76B58 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRINP3Q76B58 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRINP3Q76B58 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRINP3Q76B58 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRINP3Q76B58 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRINP3Q76B58 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRINP3Q76B58 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRINP3Q76B58 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
BRINP3Q76B58 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRINP3Q76B58 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRINP3Q76B58 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRINP3Q76B58 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRINP3Q76B58 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRINP3Q76B58 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRINP3Q76B58 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRINP3Q76B58 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRINP3Q76B58 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRINP3Q76B58 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRINP3Q76B58 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRINP3Q76B58 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRINP3Q76B58 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
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