Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW60

PCSK4, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 4, humanhuman

Predictions only

Length 755 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK4Q6UW60 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCSK4Q6UW60 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCSK4Q6UW60 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCSK4Q6UW60 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCSK4Q6UW60 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCSK4Q6UW60 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCSK4Q6UW60 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PCSK4Q6UW60 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCSK4Q6UW60 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCSK4Q6UW60 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCSK4Q6UW60 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCSK4Q6UW60 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCSK4Q6UW60 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCSK4Q6UW60 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCSK4Q6UW60 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCSK4Q6UW60 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCSK4Q6UW60 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PCSK4Q6UW60 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCSK4Q6UW60 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCSK4Q6UW60 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCSK4Q6UW60 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCSK4Q6UW60 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCSK4Q6UW60 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCSK4Q6UW60 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCSK4Q6UW60 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCSK4Q6UW60 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCSK4Q6UW60 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCSK4Q6UW60 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCSK4Q6UW60 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCSK4Q6UW60 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCSK4Q6UW60 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCSK4Q6UW60 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCSK4Q6UW60 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCSK4Q6UW60 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCSK4Q6UW60 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCSK4Q6UW60 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCSK4Q6UW60 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCSK4Q6UW60 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCSK4Q6UW60 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCSK4Q6UW60 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCSK4Q6UW60 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PCSK4Q6UW60 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCSK4Q6UW60 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCSK4Q6UW60 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCSK4Q6UW60 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCSK4Q6UW60 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCSK4Q6UW60 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCSK4Q6UW60 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCSK4Q6UW60 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCSK4Q6UW60 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCSK4Q6UW60 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCSK4Q6UW60 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PCSK4Q6UW60 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCSK4Q6UW60 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCSK4Q6UW60 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PCSK4Q6UW60 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PCSK4Q6UW60 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCSK4Q6UW60 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCSK4Q6UW60 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCSK4Q6UW60 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCSK4Q6UW60 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCSK4Q6UW60 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCSK4Q6UW60 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCSK4Q6UW60 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCSK4Q6UW60 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCSK4Q6UW60 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCSK4Q6UW60 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCSK4Q6UW60 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCSK4Q6UW60 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCSK4Q6UW60 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCSK4Q6UW60 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCSK4Q6UW60 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCSK4Q6UW60 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCSK4Q6UW60 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCSK4Q6UW60 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PCSK4Q6UW60 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCSK4Q6UW60 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCSK4Q6UW60 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCSK4Q6UW60 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCSK4Q6UW60 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCSK4Q6UW60 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCSK4Q6UW60 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCSK4Q6UW60 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCSK4Q6UW60 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCSK4Q6UW60 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCSK4Q6UW60 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCSK4Q6UW60 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCSK4Q6UW60 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCSK4Q6UW60 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCSK4Q6UW60 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCSK4Q6UW60 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCSK4Q6UW60 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCSK4Q6UW60 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCSK4Q6UW60 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCSK4Q6UW60 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PCSK4Q6UW60 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PCSK4Q6UW60 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCSK4Q6UW60 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCSK4Q6UW60 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCSK4Q6UW60 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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