Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ49

SDE2, Protein SDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDE2Q6IQ49 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SDE2Q6IQ49 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SDE2Q6IQ49 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SDE2Q6IQ49 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SDE2Q6IQ49 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SDE2Q6IQ49 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SDE2Q6IQ49 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SDE2Q6IQ49 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SDE2Q6IQ49 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SDE2Q6IQ49 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SDE2Q6IQ49 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SDE2Q6IQ49 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SDE2Q6IQ49 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SDE2Q6IQ49 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SDE2Q6IQ49 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SDE2Q6IQ49 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SDE2Q6IQ49 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SDE2Q6IQ49 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SDE2Q6IQ49 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SDE2Q6IQ49 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SDE2Q6IQ49 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SDE2Q6IQ49 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SDE2Q6IQ49 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SDE2Q6IQ49 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SDE2Q6IQ49 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SDE2Q6IQ49 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SDE2Q6IQ49 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SDE2Q6IQ49 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SDE2Q6IQ49 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SDE2Q6IQ49 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SDE2Q6IQ49 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SDE2Q6IQ49 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SDE2Q6IQ49 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SDE2Q6IQ49 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SDE2Q6IQ49 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SDE2Q6IQ49 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SDE2Q6IQ49 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SDE2Q6IQ49 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SDE2Q6IQ49 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SDE2Q6IQ49 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SDE2Q6IQ49 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SDE2Q6IQ49 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SDE2Q6IQ49 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SDE2Q6IQ49 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SDE2Q6IQ49 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SDE2Q6IQ49 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SDE2Q6IQ49 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SDE2Q6IQ49 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SDE2Q6IQ49 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SDE2Q6IQ49 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SDE2Q6IQ49 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SDE2Q6IQ49 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SDE2Q6IQ49 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SDE2Q6IQ49 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SDE2Q6IQ49 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SDE2Q6IQ49 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SDE2Q6IQ49 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SDE2Q6IQ49 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SDE2Q6IQ49 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SDE2Q6IQ49 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SDE2Q6IQ49 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SDE2Q6IQ49 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SDE2Q6IQ49 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SDE2Q6IQ49 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SDE2Q6IQ49 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SDE2Q6IQ49 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SDE2Q6IQ49 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SDE2Q6IQ49 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SDE2Q6IQ49 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SDE2Q6IQ49 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SDE2Q6IQ49 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SDE2Q6IQ49 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SDE2Q6IQ49 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SDE2Q6IQ49 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SDE2Q6IQ49 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SDE2Q6IQ49 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SDE2Q6IQ49 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SDE2Q6IQ49 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SDE2Q6IQ49 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SDE2Q6IQ49 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SDE2Q6IQ49 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SDE2Q6IQ49 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SDE2Q6IQ49 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SDE2Q6IQ49 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SDE2Q6IQ49 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SDE2Q6IQ49 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SDE2Q6IQ49 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SDE2Q6IQ49 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SDE2Q6IQ49 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SDE2Q6IQ49 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SDE2Q6IQ49 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SDE2Q6IQ49 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SDE2Q6IQ49 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SDE2Q6IQ49 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SDE2Q6IQ49 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SDE2Q6IQ49 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SDE2Q6IQ49 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SDE2Q6IQ49 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SDE2Q6IQ49 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SDE2Q6IQ49 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms