Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATL3Q6DD88 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATL3Q6DD88 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATL3Q6DD88 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATL3Q6DD88 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATL3Q6DD88 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATL3Q6DD88 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATL3Q6DD88 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATL3Q6DD88 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATL3Q6DD88 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATL3Q6DD88 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATL3Q6DD88 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATL3Q6DD88 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATL3Q6DD88 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATL3Q6DD88 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATL3Q6DD88 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATL3Q6DD88 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATL3Q6DD88 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATL3Q6DD88 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATL3Q6DD88 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATL3Q6DD88 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATL3Q6DD88 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATL3Q6DD88 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATL3Q6DD88 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ATL3Q6DD88 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ATL3Q6DD88 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ATL3Q6DD88 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATL3Q6DD88 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATL3Q6DD88 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ATL3Q6DD88 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ATL3Q6DD88 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATL3Q6DD88 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATL3Q6DD88 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATL3Q6DD88 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATL3Q6DD88 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATL3Q6DD88 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATL3Q6DD88 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATL3Q6DD88 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATL3Q6DD88 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATL3Q6DD88 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATL3Q6DD88 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATL3Q6DD88 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATL3Q6DD88 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATL3Q6DD88 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATL3Q6DD88 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATL3Q6DD88 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATL3Q6DD88 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATL3Q6DD88 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATL3Q6DD88 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATL3Q6DD88 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATL3Q6DD88 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATL3Q6DD88 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATL3Q6DD88 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATL3Q6DD88 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATL3Q6DD88 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATL3Q6DD88 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATL3Q6DD88 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATL3Q6DD88 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATL3Q6DD88 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATL3Q6DD88 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATL3Q6DD88 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATL3Q6DD88 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATL3Q6DD88 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATL3Q6DD88 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATL3Q6DD88 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ATL3Q6DD88 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATL3Q6DD88 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATL3Q6DD88 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATL3Q6DD88 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATL3Q6DD88 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ATL3Q6DD88 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATL3Q6DD88 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATL3Q6DD88 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATL3Q6DD88 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATL3Q6DD88 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATL3Q6DD88 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATL3Q6DD88 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATL3Q6DD88 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATL3Q6DD88 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATL3Q6DD88 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATL3Q6DD88 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATL3Q6DD88 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATL3Q6DD88 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATL3Q6DD88 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATL3Q6DD88 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATL3Q6DD88 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATL3Q6DD88 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATL3Q6DD88 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATL3Q6DD88 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATL3Q6DD88 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATL3Q6DD88 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATL3Q6DD88 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATL3Q6DD88 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATL3Q6DD88 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATL3Q6DD88 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATL3Q6DD88 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATL3Q6DD88 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATL3Q6DD88 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ATL3Q6DD88 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATL3Q6DD88 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms