Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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SAMD13Q5VXD3 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SAMD13Q5VXD3 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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SAMD13Q5VXD3 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SAMD13Q5VXD3 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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SAMD13Q5VXD3 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SAMD13Q5VXD3 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SAMD13Q5VXD3 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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SAMD13Q5VXD3 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
SAMD13Q5VXD3 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SAMD13Q5VXD3 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SAMD13Q5VXD3 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SAMD13Q5VXD3 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SAMD13Q5VXD3 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SAMD13Q5VXD3 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SAMD13Q5VXD3 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SAMD13Q5VXD3 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SAMD13Q5VXD3 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SAMD13Q5VXD3 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SAMD13Q5VXD3 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SAMD13Q5VXD3 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SAMD13Q5VXD3 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SAMD13Q5VXD3 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SAMD13Q5VXD3 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SAMD13Q5VXD3 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SAMD13Q5VXD3 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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