Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
COL24A1Q17RW2 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
COL24A1Q17RW2 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
COL24A1Q17RW2 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
COL24A1Q17RW2 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
COL24A1Q17RW2 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
COL24A1Q17RW2 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
COL24A1Q17RW2 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
COL24A1Q17RW2 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
COL24A1Q17RW2 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
COL24A1Q17RW2 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
COL24A1Q17RW2 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
COL24A1Q17RW2 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
COL24A1Q17RW2 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
COL24A1Q17RW2 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
COL24A1Q17RW2 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
COL24A1Q17RW2 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
COL24A1Q17RW2 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
COL24A1Q17RW2 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
COL24A1Q17RW2 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
COL24A1Q17RW2 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
COL24A1Q17RW2 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
COL24A1Q17RW2 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
COL24A1Q17RW2 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
COL24A1Q17RW2 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
COL24A1Q17RW2 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
COL24A1Q17RW2 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
COL24A1Q17RW2 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
COL24A1Q17RW2 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
COL24A1Q17RW2 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
COL24A1Q17RW2 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
COL24A1Q17RW2 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
COL24A1Q17RW2 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
COL24A1Q17RW2 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
COL24A1Q17RW2 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
COL24A1Q17RW2 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
COL24A1Q17RW2 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
COL24A1Q17RW2 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
COL24A1Q17RW2 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
COL24A1Q17RW2 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
COL24A1Q17RW2 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
COL24A1Q17RW2 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
COL24A1Q17RW2 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
COL24A1Q17RW2 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
COL24A1Q17RW2 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
COL24A1Q17RW2 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
COL24A1Q17RW2 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
COL24A1Q17RW2 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
COL24A1Q17RW2 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
COL24A1Q17RW2 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
COL24A1Q17RW2 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
COL24A1Q17RW2 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
COL24A1Q17RW2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
COL24A1Q17RW2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
COL24A1Q17RW2 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
COL24A1Q17RW2 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
COL24A1Q17RW2 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
COL24A1Q17RW2 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
COL24A1Q17RW2 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
COL24A1Q17RW2 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
COL24A1Q17RW2 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
COL24A1Q17RW2 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
COL24A1Q17RW2 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
COL24A1Q17RW2 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
COL24A1Q17RW2 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
COL24A1Q17RW2 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
COL24A1Q17RW2 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
COL24A1Q17RW2 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
COL24A1Q17RW2 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
COL24A1Q17RW2 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
COL24A1Q17RW2 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
COL24A1Q17RW2 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
COL24A1Q17RW2 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
COL24A1Q17RW2 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
COL24A1Q17RW2 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
COL24A1Q17RW2 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
COL24A1Q17RW2 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
COL24A1Q17RW2 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
COL24A1Q17RW2 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
COL24A1Q17RW2 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
COL24A1Q17RW2 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
COL24A1Q17RW2 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
COL24A1Q17RW2 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
COL24A1Q17RW2 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
COL24A1Q17RW2 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
COL24A1Q17RW2 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
COL24A1Q17RW2 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
COL24A1Q17RW2 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
COL24A1Q17RW2 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
COL24A1Q17RW2 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
COL24A1Q17RW2 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
COL24A1Q17RW2 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
COL24A1Q17RW2 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
COL24A1Q17RW2 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
COL24A1Q17RW2 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
COL24A1Q17RW2 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
COL24A1Q17RW2 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
COL24A1Q17RW2 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
COL24A1Q17RW2 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
COL24A1Q17RW2 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms