Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CDKN3Q16667 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
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