Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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RPE65Q16518 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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RPE65Q16518 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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RPE65Q16518 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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RPE65Q16518 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPE65Q16518 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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