Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SIX1Q15475 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
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