Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PUM3Q15397 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PUM3Q15397 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms