Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PDGFRLQ15198 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDGFRLQ15198 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
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