Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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