Protein–RNA interactions for Protein: Q15054

POLD3, DNA polymerase delta subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD3Q15054 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
POLD3Q15054 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLD3Q15054 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms