Protein–RNA interactions for Protein: Q14019

COTL1, Coactosin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COTL1Q14019 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
COTL1Q14019 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
COTL1Q14019 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
COTL1Q14019 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
COTL1Q14019 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
COTL1Q14019 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
COTL1Q14019 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
COTL1Q14019 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
COTL1Q14019 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC12.71□□□□□ -0.38
COTL1Q14019 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
COTL1Q14019 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
COTL1Q14019 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
COTL1Q14019 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
COTL1Q14019 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
COTL1Q14019 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
COTL1Q14019 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
COTL1Q14019 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
COTL1Q14019 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
COTL1Q14019 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
COTL1Q14019 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
COTL1Q14019 NCOR2-201ENST00000356219 7226 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
COTL1Q14019 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
COTL1Q14019 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
COTL1Q14019 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
COTL1Q14019 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
COTL1Q14019 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
COTL1Q14019 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
COTL1Q14019 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
COTL1Q14019 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
COTL1Q14019 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
COTL1Q14019 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
COTL1Q14019 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
COTL1Q14019 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
COTL1Q14019 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
COTL1Q14019 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
COTL1Q14019 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
COTL1Q14019 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
COTL1Q14019 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
COTL1Q14019 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
COTL1Q14019 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
COTL1Q14019 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
COTL1Q14019 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC12.7□□□□□ -0.38
COTL1Q14019 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
COTL1Q14019 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
COTL1Q14019 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
COTL1Q14019 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
COTL1Q14019 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
COTL1Q14019 ARNTL-202ENST00000401424 2788 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
COTL1Q14019 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
COTL1Q14019 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
COTL1Q14019 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
COTL1Q14019 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
COTL1Q14019 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
COTL1Q14019 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
COTL1Q14019 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
COTL1Q14019 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
COTL1Q14019 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
COTL1Q14019 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
COTL1Q14019 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
COTL1Q14019 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
COTL1Q14019 SIAE-201ENST00000263593 5583 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
COTL1Q14019 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
COTL1Q14019 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
COTL1Q14019 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
COTL1Q14019 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
COTL1Q14019 C21orf62-AS1-201ENST00000382375 2453 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
COTL1Q14019 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
COTL1Q14019 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
COTL1Q14019 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
COTL1Q14019 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
COTL1Q14019 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
COTL1Q14019 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
COTL1Q14019 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
COTL1Q14019 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
COTL1Q14019 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
COTL1Q14019 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
COTL1Q14019 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
COTL1Q14019 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
COTL1Q14019 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
COTL1Q14019 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
COTL1Q14019 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
COTL1Q14019 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
COTL1Q14019 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
COTL1Q14019 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
COTL1Q14019 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
COTL1Q14019 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
COTL1Q14019 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
COTL1Q14019 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
COTL1Q14019 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
COTL1Q14019 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
COTL1Q14019 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
COTL1Q14019 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
COTL1Q14019 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
COTL1Q14019 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
COTL1Q14019 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
COTL1Q14019 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
COTL1Q14019 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
COTL1Q14019 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
COTL1Q14019 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
COTL1Q14019 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms