Protein–RNA interactions for Protein: Q13972

RASGRF1, Ras-specific guanine nucleotide-releasing factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGRF1Q13972 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RASGRF1Q13972 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RASGRF1Q13972 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RASGRF1Q13972 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RASGRF1Q13972 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RASGRF1Q13972 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RASGRF1Q13972 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RASGRF1Q13972 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RASGRF1Q13972 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RASGRF1Q13972 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RASGRF1Q13972 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RASGRF1Q13972 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RASGRF1Q13972 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RASGRF1Q13972 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
RASGRF1Q13972 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RASGRF1Q13972 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RASGRF1Q13972 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RASGRF1Q13972 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
RASGRF1Q13972 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RASGRF1Q13972 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RASGRF1Q13972 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
RASGRF1Q13972 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
RASGRF1Q13972 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RASGRF1Q13972 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RASGRF1Q13972 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RASGRF1Q13972 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RASGRF1Q13972 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RASGRF1Q13972 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RASGRF1Q13972 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RASGRF1Q13972 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
RASGRF1Q13972 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RASGRF1Q13972 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RASGRF1Q13972 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RASGRF1Q13972 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RASGRF1Q13972 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RASGRF1Q13972 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RASGRF1Q13972 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RASGRF1Q13972 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RASGRF1Q13972 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RASGRF1Q13972 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RASGRF1Q13972 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RASGRF1Q13972 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RASGRF1Q13972 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RASGRF1Q13972 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RASGRF1Q13972 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
RASGRF1Q13972 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RASGRF1Q13972 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RASGRF1Q13972 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RASGRF1Q13972 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RASGRF1Q13972 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RASGRF1Q13972 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RASGRF1Q13972 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RASGRF1Q13972 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RASGRF1Q13972 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RASGRF1Q13972 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RASGRF1Q13972 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RASGRF1Q13972 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RASGRF1Q13972 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RASGRF1Q13972 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RASGRF1Q13972 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RASGRF1Q13972 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RASGRF1Q13972 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RASGRF1Q13972 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RASGRF1Q13972 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RASGRF1Q13972 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RASGRF1Q13972 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RASGRF1Q13972 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RASGRF1Q13972 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RASGRF1Q13972 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RASGRF1Q13972 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RASGRF1Q13972 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RASGRF1Q13972 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RASGRF1Q13972 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RASGRF1Q13972 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RASGRF1Q13972 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RASGRF1Q13972 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RASGRF1Q13972 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RASGRF1Q13972 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RASGRF1Q13972 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RASGRF1Q13972 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
RASGRF1Q13972 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RASGRF1Q13972 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
RASGRF1Q13972 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RASGRF1Q13972 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RASGRF1Q13972 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
RASGRF1Q13972 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RASGRF1Q13972 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RASGRF1Q13972 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RASGRF1Q13972 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RASGRF1Q13972 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RASGRF1Q13972 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RASGRF1Q13972 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RASGRF1Q13972 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RASGRF1Q13972 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RASGRF1Q13972 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RASGRF1Q13972 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RASGRF1Q13972 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RASGRF1Q13972 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RASGRF1Q13972 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RASGRF1Q13972 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
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