Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SHROOM2Q13796 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SHROOM2Q13796 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
SHROOM2Q13796 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
SHROOM2Q13796 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SHROOM2Q13796 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SHROOM2Q13796 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SHROOM2Q13796 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SHROOM2Q13796 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SHROOM2Q13796 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
SHROOM2Q13796 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SHROOM2Q13796 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SHROOM2Q13796 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SHROOM2Q13796 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SHROOM2Q13796 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SHROOM2Q13796 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
SHROOM2Q13796 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
SHROOM2Q13796 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SHROOM2Q13796 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SHROOM2Q13796 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SHROOM2Q13796 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SHROOM2Q13796 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SHROOM2Q13796 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SHROOM2Q13796 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SHROOM2Q13796 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SHROOM2Q13796 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SHROOM2Q13796 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
SHROOM2Q13796 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
SHROOM2Q13796 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
SHROOM2Q13796 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SHROOM2Q13796 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SHROOM2Q13796 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SHROOM2Q13796 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SHROOM2Q13796 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SHROOM2Q13796 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SHROOM2Q13796 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SHROOM2Q13796 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SHROOM2Q13796 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SHROOM2Q13796 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SHROOM2Q13796 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SHROOM2Q13796 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SHROOM2Q13796 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SHROOM2Q13796 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SHROOM2Q13796 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SHROOM2Q13796 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SHROOM2Q13796 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SHROOM2Q13796 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SHROOM2Q13796 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SHROOM2Q13796 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SHROOM2Q13796 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SHROOM2Q13796 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SHROOM2Q13796 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SHROOM2Q13796 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SHROOM2Q13796 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SHROOM2Q13796 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SHROOM2Q13796 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SHROOM2Q13796 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SHROOM2Q13796 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SHROOM2Q13796 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SHROOM2Q13796 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SHROOM2Q13796 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SHROOM2Q13796 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SHROOM2Q13796 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SHROOM2Q13796 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SHROOM2Q13796 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SHROOM2Q13796 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SHROOM2Q13796 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SHROOM2Q13796 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SHROOM2Q13796 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SHROOM2Q13796 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SHROOM2Q13796 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SHROOM2Q13796 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SHROOM2Q13796 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SHROOM2Q13796 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SHROOM2Q13796 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SHROOM2Q13796 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SHROOM2Q13796 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SHROOM2Q13796 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SHROOM2Q13796 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SHROOM2Q13796 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SHROOM2Q13796 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SHROOM2Q13796 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SHROOM2Q13796 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SHROOM2Q13796 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SHROOM2Q13796 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SHROOM2Q13796 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SHROOM2Q13796 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SHROOM2Q13796 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SHROOM2Q13796 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SHROOM2Q13796 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SHROOM2Q13796 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SHROOM2Q13796 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SHROOM2Q13796 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SHROOM2Q13796 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SHROOM2Q13796 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SHROOM2Q13796 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SHROOM2Q13796 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SHROOM2Q13796 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SHROOM2Q13796 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SHROOM2Q13796 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
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