Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
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