Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDH18Q13634 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms