Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Length 980 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
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PEX6Q13608 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
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