Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NFX1Q12986 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
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