Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EXOSC9Q06265 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms