Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATP7AQ04656 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP7AQ04656 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms