Protein–RNA interactions for Protein: Q03591

CFHR1, Complement factor H-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFHR1Q03591 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CFHR1Q03591 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms