Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ERCC6Q03468 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ERCC6Q03468 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ERCC6Q03468 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ERCC6Q03468 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ERCC6Q03468 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ERCC6Q03468 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ERCC6Q03468 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ERCC6Q03468 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ERCC6Q03468 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ERCC6Q03468 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ERCC6Q03468 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ERCC6Q03468 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ERCC6Q03468 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ERCC6Q03468 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ERCC6Q03468 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ERCC6Q03468 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ERCC6Q03468 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ERCC6Q03468 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ERCC6Q03468 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
ERCC6Q03468 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ERCC6Q03468 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ERCC6Q03468 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ERCC6Q03468 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ERCC6Q03468 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ERCC6Q03468 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ERCC6Q03468 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ERCC6Q03468 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ERCC6Q03468 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ERCC6Q03468 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ERCC6Q03468 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ERCC6Q03468 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ERCC6Q03468 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
ERCC6Q03468 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ERCC6Q03468 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ERCC6Q03468 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ERCC6Q03468 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ERCC6Q03468 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ERCC6Q03468 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ERCC6Q03468 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ERCC6Q03468 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ERCC6Q03468 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ERCC6Q03468 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ERCC6Q03468 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ERCC6Q03468 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ERCC6Q03468 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ERCC6Q03468 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
ERCC6Q03468 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
ERCC6Q03468 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
ERCC6Q03468 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
ERCC6Q03468 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ERCC6Q03468 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ERCC6Q03468 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ERCC6Q03468 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ERCC6Q03468 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ERCC6Q03468 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ERCC6Q03468 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ERCC6Q03468 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ERCC6Q03468 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ERCC6Q03468 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ERCC6Q03468 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ERCC6Q03468 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
ERCC6Q03468 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ERCC6Q03468 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ERCC6Q03468 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ERCC6Q03468 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ERCC6Q03468 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ERCC6Q03468 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ERCC6Q03468 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ERCC6Q03468 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ERCC6Q03468 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
ERCC6Q03468 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ERCC6Q03468 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ERCC6Q03468 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ERCC6Q03468 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ERCC6Q03468 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ERCC6Q03468 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ERCC6Q03468 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ERCC6Q03468 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ERCC6Q03468 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ERCC6Q03468 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ERCC6Q03468 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ERCC6Q03468 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ERCC6Q03468 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
ERCC6Q03468 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
ERCC6Q03468 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ERCC6Q03468 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms