Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CENPCQ03188 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms