Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

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Length 133 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IFITM3Q01628 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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