Protein–RNA interactions for Protein: P81877

SSBP2, Single-stranded DNA-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP2P81877 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSBP2P81877 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSBP2P81877 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SSBP2P81877 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SSBP2P81877 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SSBP2P81877 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSBP2P81877 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSBP2P81877 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSBP2P81877 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSBP2P81877 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSBP2P81877 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSBP2P81877 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSBP2P81877 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSBP2P81877 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSBP2P81877 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSBP2P81877 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSBP2P81877 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSBP2P81877 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSBP2P81877 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSBP2P81877 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSBP2P81877 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSBP2P81877 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSBP2P81877 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SSBP2P81877 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SSBP2P81877 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP2P81877 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP2P81877 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP2P81877 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP2P81877 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP2P81877 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP2P81877 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP2P81877 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP2P81877 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP2P81877 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP2P81877 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP2P81877 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP2P81877 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP2P81877 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP2P81877 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP2P81877 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP2P81877 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP2P81877 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP2P81877 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP2P81877 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP2P81877 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP2P81877 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP2P81877 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP2P81877 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP2P81877 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP2P81877 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP2P81877 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP2P81877 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP2P81877 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP2P81877 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP2P81877 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP2P81877 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP2P81877 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP2P81877 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP2P81877 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP2P81877 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP2P81877 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP2P81877 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP2P81877 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP2P81877 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP2P81877 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP2P81877 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP2P81877 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP2P81877 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP2P81877 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP2P81877 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP2P81877 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP2P81877 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSBP2P81877 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSBP2P81877 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSBP2P81877 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSBP2P81877 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSBP2P81877 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSBP2P81877 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSBP2P81877 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSBP2P81877 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSBP2P81877 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSBP2P81877 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSBP2P81877 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSBP2P81877 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSBP2P81877 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSBP2P81877 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSBP2P81877 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSBP2P81877 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSBP2P81877 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSBP2P81877 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSBP2P81877 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSBP2P81877 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSBP2P81877 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSBP2P81877 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSBP2P81877 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSBP2P81877 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSBP2P81877 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSBP2P81877 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSBP2P81877 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSBP2P81877 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms