Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.2 ms