Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLK1P49759 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLK1P49759 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLK1P49759 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLK1P49759 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLK1P49759 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLK1P49759 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLK1P49759 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CLK1P49759 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLK1P49759 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLK1P49759 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CLK1P49759 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLK1P49759 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLK1P49759 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CLK1P49759 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLK1P49759 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLK1P49759 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLK1P49759 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLK1P49759 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLK1P49759 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CLK1P49759 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLK1P49759 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CLK1P49759 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLK1P49759 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLK1P49759 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLK1P49759 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLK1P49759 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLK1P49759 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLK1P49759 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLK1P49759 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLK1P49759 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CLK1P49759 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLK1P49759 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLK1P49759 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLK1P49759 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLK1P49759 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLK1P49759 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLK1P49759 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLK1P49759 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLK1P49759 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLK1P49759 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLK1P49759 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLK1P49759 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLK1P49759 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLK1P49759 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLK1P49759 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLK1P49759 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLK1P49759 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLK1P49759 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLK1P49759 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLK1P49759 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLK1P49759 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CLK1P49759 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CLK1P49759 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CLK1P49759 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLK1P49759 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLK1P49759 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLK1P49759 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLK1P49759 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLK1P49759 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLK1P49759 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLK1P49759 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLK1P49759 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLK1P49759 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLK1P49759 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLK1P49759 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLK1P49759 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLK1P49759 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLK1P49759 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLK1P49759 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLK1P49759 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLK1P49759 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLK1P49759 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLK1P49759 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLK1P49759 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLK1P49759 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLK1P49759 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLK1P49759 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLK1P49759 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLK1P49759 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLK1P49759 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLK1P49759 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLK1P49759 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLK1P49759 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLK1P49759 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLK1P49759 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLK1P49759 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLK1P49759 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLK1P49759 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLK1P49759 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLK1P49759 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLK1P49759 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLK1P49759 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLK1P49759 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLK1P49759 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLK1P49759 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLK1P49759 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLK1P49759 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLK1P49759 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CLK1P49759 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms