Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
NESP48681 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NESP48681 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
NESP48681 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NESP48681 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NESP48681 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NESP48681 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NESP48681 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NESP48681 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NESP48681 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NESP48681 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NESP48681 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NESP48681 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NESP48681 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NESP48681 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NESP48681 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NESP48681 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NESP48681 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NESP48681 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NESP48681 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NESP48681 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NESP48681 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NESP48681 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NESP48681 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NESP48681 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NESP48681 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NESP48681 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NESP48681 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NESP48681 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NESP48681 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NESP48681 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
NESP48681 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NESP48681 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NESP48681 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NESP48681 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NESP48681 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NESP48681 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NESP48681 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NESP48681 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NESP48681 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NESP48681 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NESP48681 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NESP48681 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NESP48681 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NESP48681 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NESP48681 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NESP48681 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NESP48681 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
NESP48681 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
NESP48681 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NESP48681 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NESP48681 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NESP48681 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
NESP48681 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
NESP48681 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NESP48681 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NESP48681 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
NESP48681 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NESP48681 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NESP48681 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NESP48681 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NESP48681 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NESP48681 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NESP48681 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NESP48681 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NESP48681 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NESP48681 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
NESP48681 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NESP48681 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NESP48681 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
NESP48681 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
NESP48681 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NESP48681 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NESP48681 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NESP48681 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NESP48681 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NESP48681 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NESP48681 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NESP48681 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NESP48681 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NESP48681 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NESP48681 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NESP48681 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NESP48681 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NESP48681 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NESP48681 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
NESP48681 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NESP48681 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NESP48681 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NESP48681 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NESP48681 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NESP48681 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NESP48681 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NESP48681 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NESP48681 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NESP48681 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NESP48681 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NESP48681 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
NESP48681 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NESP48681 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms