Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UTRNP46939 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
UTRNP46939 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UTRNP46939 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
UTRNP46939 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UTRNP46939 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UTRNP46939 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
UTRNP46939 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UTRNP46939 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UTRNP46939 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UTRNP46939 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UTRNP46939 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UTRNP46939 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UTRNP46939 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UTRNP46939 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UTRNP46939 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UTRNP46939 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UTRNP46939 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UTRNP46939 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UTRNP46939 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UTRNP46939 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UTRNP46939 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UTRNP46939 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UTRNP46939 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UTRNP46939 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
UTRNP46939 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
UTRNP46939 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
UTRNP46939 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
UTRNP46939 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UTRNP46939 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
UTRNP46939 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UTRNP46939 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UTRNP46939 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UTRNP46939 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UTRNP46939 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UTRNP46939 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UTRNP46939 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UTRNP46939 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UTRNP46939 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UTRNP46939 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
UTRNP46939 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UTRNP46939 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UTRNP46939 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UTRNP46939 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UTRNP46939 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UTRNP46939 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UTRNP46939 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UTRNP46939 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UTRNP46939 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UTRNP46939 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UTRNP46939 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
UTRNP46939 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UTRNP46939 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UTRNP46939 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UTRNP46939 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UTRNP46939 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UTRNP46939 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
UTRNP46939 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UTRNP46939 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UTRNP46939 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UTRNP46939 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UTRNP46939 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UTRNP46939 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UTRNP46939 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UTRNP46939 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UTRNP46939 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UTRNP46939 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UTRNP46939 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UTRNP46939 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UTRNP46939 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UTRNP46939 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UTRNP46939 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UTRNP46939 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UTRNP46939 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
UTRNP46939 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UTRNP46939 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UTRNP46939 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UTRNP46939 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UTRNP46939 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UTRNP46939 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UTRNP46939 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UTRNP46939 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UTRNP46939 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UTRNP46939 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UTRNP46939 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UTRNP46939 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UTRNP46939 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UTRNP46939 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UTRNP46939 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UTRNP46939 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UTRNP46939 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UTRNP46939 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UTRNP46939 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
UTRNP46939 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UTRNP46939 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UTRNP46939 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UTRNP46939 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UTRNP46939 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UTRNP46939 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UTRNP46939 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms