Protein–RNA interactions for Protein: P43026

GDF5, Growth/differentiation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF5P43026 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDF5P43026 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDF5P43026 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDF5P43026 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDF5P43026 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDF5P43026 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDF5P43026 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDF5P43026 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDF5P43026 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDF5P43026 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDF5P43026 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDF5P43026 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GDF5P43026 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDF5P43026 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDF5P43026 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDF5P43026 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDF5P43026 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDF5P43026 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDF5P43026 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDF5P43026 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDF5P43026 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDF5P43026 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDF5P43026 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDF5P43026 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GDF5P43026 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDF5P43026 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDF5P43026 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GDF5P43026 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDF5P43026 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDF5P43026 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDF5P43026 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GDF5P43026 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GDF5P43026 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDF5P43026 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GDF5P43026 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GDF5P43026 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDF5P43026 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDF5P43026 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDF5P43026 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDF5P43026 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDF5P43026 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDF5P43026 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDF5P43026 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDF5P43026 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDF5P43026 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDF5P43026 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDF5P43026 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDF5P43026 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDF5P43026 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDF5P43026 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDF5P43026 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDF5P43026 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GDF5P43026 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GDF5P43026 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GDF5P43026 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GDF5P43026 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GDF5P43026 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GDF5P43026 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GDF5P43026 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GDF5P43026 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GDF5P43026 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GDF5P43026 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GDF5P43026 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GDF5P43026 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GDF5P43026 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GDF5P43026 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GDF5P43026 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GDF5P43026 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GDF5P43026 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GDF5P43026 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GDF5P43026 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GDF5P43026 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GDF5P43026 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GDF5P43026 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GDF5P43026 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GDF5P43026 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GDF5P43026 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GDF5P43026 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GDF5P43026 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GDF5P43026 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GDF5P43026 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GDF5P43026 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GDF5P43026 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GDF5P43026 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GDF5P43026 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GDF5P43026 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GDF5P43026 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GDF5P43026 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GDF5P43026 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GDF5P43026 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GDF5P43026 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GDF5P43026 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GDF5P43026 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GDF5P43026 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GDF5P43026 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GDF5P43026 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GDF5P43026 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GDF5P43026 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GDF5P43026 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GDF5P43026 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms