Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms