Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ABCC1P33527 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms