Protein–RNA interactions for Protein: P31270

HOXA11, Homeobox protein Hox-A11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA11P31270 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA11P31270 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA11P31270 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA11P31270 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA11P31270 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA11P31270 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA11P31270 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA11P31270 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA11P31270 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA11P31270 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA11P31270 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA11P31270 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA11P31270 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA11P31270 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA11P31270 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA11P31270 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA11P31270 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA11P31270 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA11P31270 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA11P31270 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA11P31270 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA11P31270 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA11P31270 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA11P31270 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA11P31270 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA11P31270 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA11P31270 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA11P31270 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA11P31270 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA11P31270 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA11P31270 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA11P31270 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA11P31270 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA11P31270 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA11P31270 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA11P31270 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA11P31270 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA11P31270 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA11P31270 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA11P31270 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA11P31270 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA11P31270 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA11P31270 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA11P31270 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA11P31270 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA11P31270 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA11P31270 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA11P31270 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA11P31270 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA11P31270 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA11P31270 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA11P31270 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA11P31270 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA11P31270 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA11P31270 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA11P31270 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA11P31270 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA11P31270 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA11P31270 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA11P31270 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA11P31270 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA11P31270 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA11P31270 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA11P31270 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA11P31270 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA11P31270 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA11P31270 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA11P31270 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA11P31270 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA11P31270 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA11P31270 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA11P31270 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA11P31270 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA11P31270 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA11P31270 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA11P31270 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA11P31270 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA11P31270 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA11P31270 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA11P31270 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA11P31270 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA11P31270 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA11P31270 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA11P31270 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA11P31270 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA11P31270 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA11P31270 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA11P31270 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA11P31270 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA11P31270 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA11P31270 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA11P31270 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA11P31270 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA11P31270 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA11P31270 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA11P31270 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA11P31270 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA11P31270 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.5
HOXA11P31270 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA11P31270 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms