Protein–RNA interactions for Protein: P30084

ECHS1, Enoyl-CoA hydratase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1P30084 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECHS1P30084 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECHS1P30084 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECHS1P30084 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECHS1P30084 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECHS1P30084 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECHS1P30084 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECHS1P30084 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ECHS1P30084 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECHS1P30084 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECHS1P30084 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECHS1P30084 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECHS1P30084 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECHS1P30084 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECHS1P30084 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECHS1P30084 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECHS1P30084 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECHS1P30084 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECHS1P30084 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECHS1P30084 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECHS1P30084 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ECHS1P30084 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECHS1P30084 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECHS1P30084 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECHS1P30084 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECHS1P30084 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECHS1P30084 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECHS1P30084 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECHS1P30084 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECHS1P30084 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECHS1P30084 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECHS1P30084 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECHS1P30084 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECHS1P30084 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ECHS1P30084 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECHS1P30084 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECHS1P30084 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECHS1P30084 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECHS1P30084 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECHS1P30084 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECHS1P30084 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ECHS1P30084 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECHS1P30084 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECHS1P30084 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECHS1P30084 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECHS1P30084 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ECHS1P30084 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECHS1P30084 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECHS1P30084 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECHS1P30084 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECHS1P30084 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECHS1P30084 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECHS1P30084 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECHS1P30084 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECHS1P30084 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECHS1P30084 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECHS1P30084 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECHS1P30084 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECHS1P30084 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECHS1P30084 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECHS1P30084 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECHS1P30084 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECHS1P30084 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECHS1P30084 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECHS1P30084 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECHS1P30084 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECHS1P30084 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ECHS1P30084 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ECHS1P30084 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ECHS1P30084 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ECHS1P30084 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ECHS1P30084 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ECHS1P30084 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ECHS1P30084 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ECHS1P30084 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ECHS1P30084 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ECHS1P30084 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ECHS1P30084 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ECHS1P30084 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ECHS1P30084 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ECHS1P30084 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ECHS1P30084 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ECHS1P30084 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ECHS1P30084 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ECHS1P30084 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ECHS1P30084 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ECHS1P30084 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ECHS1P30084 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ECHS1P30084 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ECHS1P30084 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ECHS1P30084 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ECHS1P30084 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ECHS1P30084 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ECHS1P30084 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ECHS1P30084 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ECHS1P30084 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ECHS1P30084 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ECHS1P30084 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ECHS1P30084 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ECHS1P30084 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.8 ms