Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLD1P28340 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLD1P28340 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
POLD1P28340 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
POLD1P28340 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLD1P28340 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLD1P28340 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLD1P28340 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLD1P28340 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLD1P28340 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLD1P28340 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLD1P28340 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLD1P28340 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLD1P28340 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
POLD1P28340 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLD1P28340 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
POLD1P28340 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
POLD1P28340 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
POLD1P28340 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLD1P28340 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLD1P28340 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
POLD1P28340 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
POLD1P28340 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
POLD1P28340 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLD1P28340 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
POLD1P28340 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLD1P28340 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLD1P28340 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLD1P28340 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLD1P28340 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLD1P28340 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
POLD1P28340 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLD1P28340 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLD1P28340 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLD1P28340 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
POLD1P28340 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLD1P28340 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLD1P28340 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLD1P28340 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLD1P28340 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLD1P28340 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLD1P28340 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLD1P28340 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLD1P28340 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLD1P28340 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
POLD1P28340 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLD1P28340 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLD1P28340 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLD1P28340 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLD1P28340 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLD1P28340 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLD1P28340 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLD1P28340 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLD1P28340 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLD1P28340 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLD1P28340 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLD1P28340 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLD1P28340 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLD1P28340 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLD1P28340 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLD1P28340 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLD1P28340 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLD1P28340 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
POLD1P28340 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLD1P28340 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLD1P28340 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLD1P28340 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLD1P28340 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLD1P28340 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLD1P28340 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLD1P28340 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLD1P28340 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLD1P28340 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLD1P28340 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLD1P28340 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLD1P28340 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLD1P28340 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLD1P28340 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLD1P28340 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLD1P28340 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLD1P28340 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLD1P28340 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLD1P28340 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLD1P28340 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLD1P28340 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLD1P28340 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLD1P28340 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLD1P28340 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLD1P28340 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLD1P28340 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLD1P28340 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLD1P28340 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
POLD1P28340 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLD1P28340 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLD1P28340 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLD1P28340 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLD1P28340 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLD1P28340 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLD1P28340 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLD1P28340 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms