Protein–RNA interactions for Protein: P21359

NF1, Neurofibromin, humanhuman

Predictions only

Length 2,839 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NF1P21359 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NF1P21359 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NF1P21359 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NF1P21359 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NF1P21359 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NF1P21359 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NF1P21359 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NF1P21359 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
NF1P21359 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NF1P21359 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NF1P21359 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NF1P21359 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NF1P21359 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NF1P21359 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NF1P21359 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NF1P21359 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NF1P21359 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NF1P21359 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NF1P21359 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NF1P21359 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NF1P21359 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NF1P21359 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NF1P21359 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NF1P21359 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NF1P21359 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NF1P21359 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NF1P21359 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NF1P21359 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
NF1P21359 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
NF1P21359 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NF1P21359 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NF1P21359 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NF1P21359 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NF1P21359 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NF1P21359 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NF1P21359 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NF1P21359 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NF1P21359 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NF1P21359 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NF1P21359 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NF1P21359 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NF1P21359 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NF1P21359 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NF1P21359 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NF1P21359 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NF1P21359 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NF1P21359 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NF1P21359 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NF1P21359 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NF1P21359 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
NF1P21359 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NF1P21359 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NF1P21359 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NF1P21359 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NF1P21359 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
NF1P21359 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NF1P21359 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NF1P21359 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NF1P21359 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NF1P21359 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NF1P21359 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NF1P21359 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NF1P21359 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NF1P21359 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NF1P21359 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NF1P21359 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NF1P21359 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NF1P21359 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NF1P21359 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NF1P21359 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NF1P21359 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NF1P21359 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
NF1P21359 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NF1P21359 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NF1P21359 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NF1P21359 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NF1P21359 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NF1P21359 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NF1P21359 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NF1P21359 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NF1P21359 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NF1P21359 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NF1P21359 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NF1P21359 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NF1P21359 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NF1P21359 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NF1P21359 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
NF1P21359 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NF1P21359 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NF1P21359 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NF1P21359 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NF1P21359 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NF1P21359 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
NF1P21359 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NF1P21359 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NF1P21359 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NF1P21359 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NF1P21359 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NF1P21359 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NF1P21359 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms