Protein–RNA interactions for Protein: P19387

POLR2C, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2CP19387 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2CP19387 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2CP19387 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2CP19387 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2CP19387 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2CP19387 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2CP19387 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2CP19387 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2CP19387 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2CP19387 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2CP19387 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2CP19387 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2CP19387 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2CP19387 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2CP19387 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2CP19387 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2CP19387 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2CP19387 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2CP19387 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2CP19387 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2CP19387 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
POLR2CP19387 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
POLR2CP19387 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2CP19387 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms