Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

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Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CTLA4P16410 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CTLA4P16410 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CTLA4P16410 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTLA4P16410 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTLA4P16410 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTLA4P16410 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CTLA4P16410 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CTLA4P16410 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTLA4P16410 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTLA4P16410 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTLA4P16410 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CTLA4P16410 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CTLA4P16410 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CTLA4P16410 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CTLA4P16410 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CTLA4P16410 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CTLA4P16410 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CTLA4P16410 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CTLA4P16410 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CTLA4P16410 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CTLA4P16410 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CTLA4P16410 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CTLA4P16410 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CTLA4P16410 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CTLA4P16410 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CTLA4P16410 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CTLA4P16410 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CTLA4P16410 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CTLA4P16410 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CTLA4P16410 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CTLA4P16410 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CTLA4P16410 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CTLA4P16410 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CTLA4P16410 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CTLA4P16410 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CTLA4P16410 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CTLA4P16410 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CTLA4P16410 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
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CTLA4P16410 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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CTLA4P16410 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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CTLA4P16410 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTLA4P16410 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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