Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GP1BBP13224 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.6 ms