Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHGAP10645 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHGAP10645 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHGAP10645 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHGAP10645 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHGAP10645 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHGAP10645 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHGAP10645 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHGAP10645 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHGAP10645 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHGAP10645 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHGAP10645 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CHGAP10645 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHGAP10645 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHGAP10645 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CHGAP10645 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHGAP10645 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHGAP10645 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHGAP10645 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHGAP10645 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHGAP10645 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHGAP10645 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHGAP10645 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHGAP10645 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHGAP10645 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHGAP10645 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CHGAP10645 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHGAP10645 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHGAP10645 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHGAP10645 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHGAP10645 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHGAP10645 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHGAP10645 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHGAP10645 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHGAP10645 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHGAP10645 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHGAP10645 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHGAP10645 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHGAP10645 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHGAP10645 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHGAP10645 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CHGAP10645 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CHGAP10645 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHGAP10645 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHGAP10645 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CHGAP10645 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CHGAP10645 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHGAP10645 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHGAP10645 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHGAP10645 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHGAP10645 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CHGAP10645 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHGAP10645 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHGAP10645 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHGAP10645 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHGAP10645 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHGAP10645 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHGAP10645 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHGAP10645 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHGAP10645 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHGAP10645 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHGAP10645 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHGAP10645 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHGAP10645 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHGAP10645 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHGAP10645 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHGAP10645 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CHGAP10645 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHGAP10645 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHGAP10645 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CHGAP10645 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CHGAP10645 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHGAP10645 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHGAP10645 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CHGAP10645 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHGAP10645 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHGAP10645 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHGAP10645 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHGAP10645 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHGAP10645 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHGAP10645 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHGAP10645 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHGAP10645 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHGAP10645 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CHGAP10645 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHGAP10645 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHGAP10645 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CHGAP10645 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CHGAP10645 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CHGAP10645 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CHGAP10645 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CHGAP10645 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CHGAP10645 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CHGAP10645 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CHGAP10645 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CHGAP10645 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHGAP10645 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHGAP10645 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHGAP10645 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHGAP10645 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms