Protein–RNA interactions for Protein: P04436

T-cell receptor alpha chain V region HPB-MLT (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04436 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04436 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04436 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04436 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04436 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04436 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04436 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04436 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04436 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04436 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04436 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04436 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04436 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04436 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04436 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04436 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04436 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04436 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04436 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04436 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04436 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04436 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P04436 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04436 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04436 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04436 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04436 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P04436 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P04436 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04436 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P04436 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04436 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04436 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04436 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04436 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04436 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04436 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04436 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04436 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04436 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04436 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04436 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04436 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04436 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04436 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04436 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04436 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04436 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04436 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04436 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04436 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04436 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04436 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04436 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04436 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04436 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04436 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04436 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04436 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04436 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04436 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04436 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04436 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04436 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04436 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04436 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04436 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04436 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04436 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04436 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04436 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04436 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04436 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04436 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04436 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04436 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04436 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04436 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04436 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04436 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04436 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04436 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04436 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04436 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04436 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04436 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P04436 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04436 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04436 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04436 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04436 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04436 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04436 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P04436 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04436 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04436 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04436 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04436 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04436 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04436 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms