Protein–RNA interactions for Protein: P02549

SPTA1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTA1P02549 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTA1P02549 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms