Protein–RNA interactions for Protein: O95219

SNX4, Sorting nexin-4, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX4O95219 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX4O95219 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX4O95219 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX4O95219 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX4O95219 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX4O95219 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX4O95219 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX4O95219 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX4O95219 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX4O95219 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX4O95219 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX4O95219 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX4O95219 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX4O95219 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX4O95219 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX4O95219 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX4O95219 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX4O95219 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX4O95219 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX4O95219 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX4O95219 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX4O95219 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX4O95219 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX4O95219 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX4O95219 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX4O95219 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX4O95219 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX4O95219 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX4O95219 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX4O95219 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX4O95219 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX4O95219 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX4O95219 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX4O95219 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX4O95219 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX4O95219 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX4O95219 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX4O95219 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX4O95219 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX4O95219 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX4O95219 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX4O95219 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX4O95219 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX4O95219 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX4O95219 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX4O95219 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX4O95219 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX4O95219 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX4O95219 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX4O95219 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX4O95219 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX4O95219 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX4O95219 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX4O95219 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX4O95219 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX4O95219 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX4O95219 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX4O95219 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX4O95219 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX4O95219 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX4O95219 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX4O95219 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX4O95219 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX4O95219 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX4O95219 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX4O95219 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX4O95219 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX4O95219 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX4O95219 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX4O95219 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX4O95219 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX4O95219 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX4O95219 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX4O95219 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX4O95219 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX4O95219 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX4O95219 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX4O95219 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX4O95219 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX4O95219 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX4O95219 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX4O95219 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX4O95219 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX4O95219 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX4O95219 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX4O95219 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX4O95219 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX4O95219 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX4O95219 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX4O95219 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX4O95219 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX4O95219 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX4O95219 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX4O95219 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX4O95219 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX4O95219 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX4O95219 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX4O95219 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX4O95219 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX4O95219 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms