Protein–RNA interactions for Protein: O75909

CCNK, Cyclin-K, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNKO75909 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCNKO75909 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCNKO75909 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCNKO75909 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCNKO75909 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCNKO75909 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCNKO75909 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CCNKO75909 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CCNKO75909 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CCNKO75909 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CCNKO75909 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CCNKO75909 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CCNKO75909 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CCNKO75909 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CCNKO75909 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CCNKO75909 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
CCNKO75909 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CCNKO75909 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CCNKO75909 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNKO75909 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNKO75909 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNKO75909 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNKO75909 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNKO75909 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNKO75909 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNKO75909 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNKO75909 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNKO75909 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNKO75909 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNKO75909 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNKO75909 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNKO75909 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNKO75909 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNKO75909 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNKO75909 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNKO75909 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNKO75909 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNKO75909 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNKO75909 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNKO75909 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNKO75909 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNKO75909 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNKO75909 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNKO75909 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNKO75909 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNKO75909 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNKO75909 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNKO75909 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNKO75909 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNKO75909 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNKO75909 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNKO75909 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNKO75909 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNKO75909 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNKO75909 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNKO75909 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNKO75909 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNKO75909 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNKO75909 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNKO75909 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNKO75909 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNKO75909 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNKO75909 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNKO75909 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNKO75909 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNKO75909 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNKO75909 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNKO75909 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNKO75909 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCNKO75909 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCNKO75909 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCNKO75909 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCNKO75909 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCNKO75909 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCNKO75909 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCNKO75909 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCNKO75909 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCNKO75909 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCNKO75909 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCNKO75909 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCNKO75909 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCNKO75909 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCNKO75909 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCNKO75909 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCNKO75909 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCNKO75909 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCNKO75909 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCNKO75909 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCNKO75909 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCNKO75909 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CCNKO75909 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCNKO75909 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCNKO75909 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CCNKO75909 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCNKO75909 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCNKO75909 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCNKO75909 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCNKO75909 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCNKO75909 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCNKO75909 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms