Protein–RNA interactions for Protein: O43567

RNF13, E3 ubiquitin-protein ligase RNF13, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF13O43567 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF13O43567 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF13O43567 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF13O43567 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF13O43567 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF13O43567 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF13O43567 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF13O43567 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF13O43567 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF13O43567 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF13O43567 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF13O43567 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF13O43567 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF13O43567 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF13O43567 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF13O43567 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF13O43567 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF13O43567 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF13O43567 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF13O43567 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF13O43567 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF13O43567 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF13O43567 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF13O43567 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF13O43567 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF13O43567 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF13O43567 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF13O43567 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF13O43567 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RNF13O43567 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RNF13O43567 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RNF13O43567 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RNF13O43567 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RNF13O43567 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF13O43567 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF13O43567 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF13O43567 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF13O43567 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF13O43567 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF13O43567 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF13O43567 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF13O43567 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF13O43567 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF13O43567 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF13O43567 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF13O43567 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF13O43567 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF13O43567 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF13O43567 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF13O43567 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF13O43567 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF13O43567 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF13O43567 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF13O43567 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF13O43567 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF13O43567 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF13O43567 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF13O43567 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF13O43567 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF13O43567 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF13O43567 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF13O43567 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF13O43567 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF13O43567 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF13O43567 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF13O43567 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF13O43567 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF13O43567 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF13O43567 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF13O43567 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF13O43567 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF13O43567 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF13O43567 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF13O43567 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF13O43567 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF13O43567 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF13O43567 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF13O43567 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF13O43567 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF13O43567 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF13O43567 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF13O43567 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF13O43567 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF13O43567 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF13O43567 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF13O43567 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF13O43567 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF13O43567 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF13O43567 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF13O43567 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF13O43567 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF13O43567 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF13O43567 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF13O43567 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF13O43567 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF13O43567 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF13O43567 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF13O43567 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF13O43567 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF13O43567 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms