Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
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SH3BP1Q9Y3L3 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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SH3BP1Q9Y3L3 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SH3BP1Q9Y3L3 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
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SH3BP1Q9Y3L3 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SH3BP1Q9Y3L3 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SH3BP1Q9Y3L3 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SH3BP1Q9Y3L3 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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SH3BP1Q9Y3L3 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SH3BP1Q9Y3L3 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SH3BP1Q9Y3L3 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SH3BP1Q9Y3L3 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SH3BP1Q9Y3L3 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SH3BP1Q9Y3L3 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SH3BP1Q9Y3L3 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SH3BP1Q9Y3L3 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SH3BP1Q9Y3L3 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SH3BP1Q9Y3L3 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SH3BP1Q9Y3L3 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SH3BP1Q9Y3L3 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SH3BP1Q9Y3L3 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SH3BP1Q9Y3L3 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SH3BP1Q9Y3L3 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SH3BP1Q9Y3L3 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
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