Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIV1

CNOT7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT7Q9UIV1 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CNOT7Q9UIV1 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CNOT7Q9UIV1 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CNOT7Q9UIV1 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CNOT7Q9UIV1 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CNOT7Q9UIV1 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CNOT7Q9UIV1 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CNOT7Q9UIV1 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CNOT7Q9UIV1 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CNOT7Q9UIV1 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CNOT7Q9UIV1 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CNOT7Q9UIV1 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNOT7Q9UIV1 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNOT7Q9UIV1 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNOT7Q9UIV1 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNOT7Q9UIV1 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNOT7Q9UIV1 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNOT7Q9UIV1 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNOT7Q9UIV1 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNOT7Q9UIV1 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNOT7Q9UIV1 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNOT7Q9UIV1 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNOT7Q9UIV1 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CNOT7Q9UIV1 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CNOT7Q9UIV1 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CNOT7Q9UIV1 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNOT7Q9UIV1 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CNOT7Q9UIV1 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNOT7Q9UIV1 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNOT7Q9UIV1 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CNOT7Q9UIV1 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNOT7Q9UIV1 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNOT7Q9UIV1 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNOT7Q9UIV1 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNOT7Q9UIV1 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNOT7Q9UIV1 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNOT7Q9UIV1 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNOT7Q9UIV1 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNOT7Q9UIV1 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNOT7Q9UIV1 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNOT7Q9UIV1 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNOT7Q9UIV1 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CNOT7Q9UIV1 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CNOT7Q9UIV1 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CNOT7Q9UIV1 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CNOT7Q9UIV1 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CNOT7Q9UIV1 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CNOT7Q9UIV1 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CNOT7Q9UIV1 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CNOT7Q9UIV1 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CNOT7Q9UIV1 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CNOT7Q9UIV1 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CNOT7Q9UIV1 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CNOT7Q9UIV1 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CNOT7Q9UIV1 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CNOT7Q9UIV1 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CNOT7Q9UIV1 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CNOT7Q9UIV1 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CNOT7Q9UIV1 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CNOT7Q9UIV1 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CNOT7Q9UIV1 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CNOT7Q9UIV1 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CNOT7Q9UIV1 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CNOT7Q9UIV1 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CNOT7Q9UIV1 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CNOT7Q9UIV1 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CNOT7Q9UIV1 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CNOT7Q9UIV1 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CNOT7Q9UIV1 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CNOT7Q9UIV1 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CNOT7Q9UIV1 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CNOT7Q9UIV1 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CNOT7Q9UIV1 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CNOT7Q9UIV1 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CNOT7Q9UIV1 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CNOT7Q9UIV1 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CNOT7Q9UIV1 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CNOT7Q9UIV1 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CNOT7Q9UIV1 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CNOT7Q9UIV1 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CNOT7Q9UIV1 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CNOT7Q9UIV1 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CNOT7Q9UIV1 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CNOT7Q9UIV1 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CNOT7Q9UIV1 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CNOT7Q9UIV1 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CNOT7Q9UIV1 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CNOT7Q9UIV1 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CNOT7Q9UIV1 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CNOT7Q9UIV1 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CNOT7Q9UIV1 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CNOT7Q9UIV1 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CNOT7Q9UIV1 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CNOT7Q9UIV1 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CNOT7Q9UIV1 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CNOT7Q9UIV1 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CNOT7Q9UIV1 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CNOT7Q9UIV1 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CNOT7Q9UIV1 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CNOT7Q9UIV1 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms