Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGM1

CHRNA9, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA9Q9UGM1 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms